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提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******

　　近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。

　　全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。

　　统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。

　　相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。

　　该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。

　　与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。

　　该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。

学术支持

中国农业科学院作物科学研究所

记者

宋雅娟

海南海口优化环境增活力******

　　发展围绕企业转 工作围绕项目转

　　海南海口优化环境增活力

　　本报海口12月20日讯（记者王伟、潘世鹏）今年以来，海南省海口市紧抓项目建设，紧盯企业“急难愁盼”问题，持续优化营商环境，增添发展活力，加快推动海南自由贸易港核心区建设。

　　近日，记者走进位于海口市西海岸南片区的中海油南海油气开发总指挥部基地，看到的是机器轰鸣、车辆奔忙的建设场景。中建二局项目负责人梅东涛说，项目建设总规模约25.29万平方米，总投资约24.45亿元。

　　今年以来，海口市深入开展“万名干部下企业”服务行动，为重点项目配备政府服务专员，服务115个省、市重点项目建设，帮助企业纾困解难。

　　同时，海口市把招商引资作为经济工作的主要抓手，逐步构建“龙头企业—产业链—产业集群”招商模式，积极为企业落地提供服务。“我们安排招商服务专员在会场驻点办公，联合海南省经发局开展招商推介活动，积极向知名品牌、龙头企业推介自贸港政策和海口发展优势。”海口市国际投资促进局局长陈量子告诉记者。

　　为服务好涉外产业主体，助推现代服务、高新技术、教育等产业高质量发展，海口市外事办日前推出了政务服务事项“即办”等措施。海口市外事办相关负责人说，得益于持续推进的商事制度改革，越来越多的企业选择到海口投资兴业。

　　海口市江东新区进一步完善重大项目推进机制，以优质高效服务促进项目攻坚。“项目专员多次主动对接，为我们打开施工面提供了便利。”海口市临空经济区涉铁配套路网项目经理芮世财表示，海口江东新区项目专员组建24小时工作群，主动对接征拆协调指挥部，解决项目诉求。

　　落户企业增长快，成为海口市经济发展一大亮点。今年前10个月，海口市新增市场主体573179户，同比增长217.16%。上半年，在海口市招商项目投资主体中，世界500强和中国500强企业合计占比达37.78%，成为投资主力。

　　海口市委副书记、市长丁晖表示，海口将按照“发展围绕企业转、工作围绕项目转”的思路，主动靠前服务，优化营商环境，全力保障高质高效完成项目建设任务，为加快建设海南自贸港核心区和现代化国际化新海口作出更大贡献。

　　（文图：赵筱尘 巫邓炎）